PacBio 기술이 현재 metagenomics 및 microbiome 연구에 어떤 영향을 미치는지 ‘Publications at a Glance’를 통해 빠르게 확인해 보세요!

Publications at a Glance 첫번째 시리즈는 미생물군유전체 및 metagnomics 연구에서 중요한 peer-reviewed article을 쉽고 빠르게 보실 수 있도록 PacBio의 scientist들이 요약한 자료입니다.
이번 시리즈에서는 논문의 주요 결과와 PacBio 기술이 연구에 어떻게 기여했는지, 그리고 향후 연구에 대한 시사점을 확인하실 수 있습니다. 

HiFi data is changing the game in microbiome and metagenomics research
장내 미생물 군집과 인간 건강 사이의 연관성을 조사하거나 자연 및 인공 환경에서 미생물 다양성의 미스터리를 풀어가는 데 있어 HiFi 시퀀싱이 제공하는 최첨단 데이터는 metagenomics에서 중요하고 영향력 있는 발견을 가능하게 합니다. 

군집의 기능과 분류를 동시에 정확하게 프로파일링합니다.
HiFi shotgun metagenomic sequencing 
평균 8개의 연속 유전자에 걸쳐 있을 수 있는 개별 리드들로 구성된 데이터 세트를 생성합니다. 전용 분석 툴과 함께 사용할 경우 HiFi 데이터는 동일한 샘플의 상세한 분류 및 기능 정보를 포함하여 획기적인 인사이트을 제공할 수 있습니다.

single-contig high quality (HQ) metagenome-assembled genomes (MAGs)을 높은 수율로 얻을 수 있습니다. 
어셈블리에 중점을 두는 HiFi metagenomic 연구에서는 최대 33%가 단일 contig인, 수십~ 수백 개의 고품질(HQ) Metagenome –assembled genome(MAG)를 캡처할 수 있으므로 유전자를 예측할 수 있고 믿을 만한  taxonomic annotation을 만들 수 있습니다.

Do it all at 15x the throughput with the Revio system
Revio 시스템은 HiFi 시퀀싱의 처리량과 비용 효율성을 크게 높이는 새로운 PacBio long read sequencing 기기입니다. 연구 목표에 따라 적절한 멀티플렉싱 전략을 사용하면 metagenomics의 비용 대비 성능이 기존 대비 15배 이상으로 향상될 수 있습니다.  

HiFi Reads Offer the Benefits of Short Reads and Long Reads in One Easy-to-Use Technology

HiFi read는 모든 변이 유형을 감지할 수 있는 높은 정확도 (> 99.9 %)와 가장 복잡한 유전체와 전체 전사체를 assemble하는데 필요한 충분히 긴 길이(최대 25kb)를 제공합니다.