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MERSCOPE 분석에서 Gene Panel Design의 중요성

2024-04-17 15:37:54

이미지 기반 공간전사체 기술과 Gene Panel Design: 세포 유형 결정의 핵심

 

공간전사체 기술은 생물학적 연구와 임상 응용의 새로운 지평을 열어가고 있습니다. 이 기술은 조직 내에서 세포 간의 복잡한 상호작용과 분자적 커뮤니케이션을 시각화하고 분석할 수 있게 돕습니다. In Situ Single-Cell Spatial Genomics platform인 MERSCOPE을 통해 이러한 복잡성을 정확하게 파악하고 이해하기 위해서는 정밀한 Gene Panel Design이 필수입니다.

 

Gene Panel Design이란, 특정 연구 목표나 임상적 응용을 위해 선택한 일련의 유전자를 말합니다. (현재 MERSCOPE 에서는 1,000개의 유전자를 선택할 수 있으며, custom panel로는 현존 기술 중 가장 많은 숫자입니다.) 공간전사체 분석에서 이는 특히 중요한데, 올바른 유전자 패널을 선택하는 것이 조직 내 다양한 세포 유형을 정확하게 식별하고 분류하는 데 결정적인 역할을 하기 때문입니다.

 

아래 그림과 같이 gene panel design에 따라 cell type을 분류하는 데 굉장히 큰 차이가 나타남을 볼 수 있습니다.

 

 

그림 A, 좋은 gene panel design이 적용된 경우

그림 B, gene panel design이 적절하지 않은 경우

 

장비가 없으시다면 Service로 Panel의 결과를 경험해 보세요! 

아래 MERSCOPE 서비스가 가능한 공간전사체 분석 전문기업인 Portrai를 통해 Panel의 결과를 경험해 보실 수 있습니다. 

 

 

왜 포트래이인가?

공간전사체 기술을 활용한 연구는 복잡한 생물학적 현상을 이해하고 새로운 치료법을 개발하는 데 있어 혁신적인 도구입니다. 포트래이는 이 기술의 잠재력을 최대한 발휘할 수 있도록, 최적화된 Gene Panel Design을 통해 연구의 정밀도와 효율성을 높여줍니다. MERSCOPE 기술과 포트래이가 디자인한 gene panel과 함께라면, 고객님의 연구가 더욱 깊이 있고 의미 있는 결과로 이어질 것입니다.

 

 

포트래이가 design 한 Gene Panel이 특별한 이유

 정밀한 Designed Gene Panel 

•  맞춤형 설계: 포트래이의 기술을 통해 다양한 조직의 cell typing 성능에 최적화된 유전자 패널을 설계하였습니다.

•  데이터 기반 결정: 수백명에 달하는 방대한 인체 조직 데이터베이스와 AI/ML 분석 도구를 활용하여, 가장 관련성 높고 정보가 풍부한 유전자를 선별합니다.

•  정밀 분석: 선별된 유전자 패널을 통해, 세포 유형을 더욱 정밀하게 분류하고 조직 내 세포 간 상호작용을 더욱 명확하게 이해할 수 있습니다.