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User-friendly Solutions to SMRT Sequencing Bioinformatics with SMRT Link

2020-08-12 15:08:28



User-friendly Solutions to
SMRT Sequencing Bioinformatics with SMRT Link


SMRT시퀀싱으로 생성한 long-read 데이터는 최첨단 유전체학 연구의 핵심입니다.
전통적으로,
일반사용자에게 친숙하지 않은 생물정보학 툴을 활용하는데는 비용이 듭니다. 
PacBio는 최신 Sequel 및 Sequel II 시스템의 end-to-end bioinformatics workflow 관리프로그램인 SMRT Link를 개발하였습니다. 이 프로그램은 기기 run 디자인부터 강력하고 풍부한 다운스트림 분석까지 제공합니다.

SMRT Link는 잘 설계된 그래픽 사용자 인터페이스사용자에게 친숙하면서도  많은 고급 사용자를 위한 강력한 도구 모음도 함께 제공됩니다.  최근에 공개된 SMRT Link v9.0에는 HiFi read를 생성하는 더 빠른 CCS application, 개선된 미생물 assembly pipeline, 새로운 ultra-low input 프로토콜로 생성된 데이터를 분석하는 기능 및 새로운 샘플 추적 인프라를  비롯한 여러 가지 새로운 기능이 포함되어 있습니다.


In this webinar we will:
  1. Introduce SMRT Link as the comprehensive workflow manager for all SMRT Sequencing applications.
  2. Cover the main analysis pipelines for different applications.
  3. Review the changes in the latest version v9.0.
  4. Cover new recommendations for selected analysis pipelines.
  5. Discuss command line alternatives to selected SMRT Link pipeline.

Date & Time:
2020년 813일 목요일, 오전 11(한국시간)

Speakers :

Khi Pin Chua, Ph.D.
Field Applications Support, Bioinformatics
PacBio Asia Pacific




 

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