User-friendly Solutions to
SMRT Sequencing Bioinformatics with SMRT Link
SMRT시퀀싱으로 생성한 long-read 데이터는 최첨단 유전체학 연구의 핵심입니다.
전통적으로, 일반사용자에게 친숙하지 않은 생물정보학 툴을 활용하는데는 비용이 듭니다.
PacBio는 최신 Sequel 및 Sequel II 시스템의 end-to-end bioinformatics workflow 관리프로그램인 SMRT Link를 개발하였습니다. 이 프로그램은 기기 run 디자인부터 강력하고 풍부한 다운스트림 분석까지 제공합니다.
SMRT Link는 잘 설계된 그래픽 사용자 인터페이스로 사용자에게 친숙하면서도 많은 고급 사용자를 위한 강력한 도구 모음도 함께 제공됩니다. 최근에 공개된 SMRT Link v9.0에는 HiFi read를 생성하는 더 빠른 CCS application, 개선된 미생물 assembly pipeline, 새로운 ultra-low input 프로토콜로 생성된 데이터를 분석하는 기능 및 새로운 샘플 추적 인프라를 비롯한 여러 가지 새로운 기능이 포함되어 있습니다.
In this webinar we will:
- Introduce SMRT Link as the comprehensive workflow manager for all SMRT Sequencing applications.
- Cover the main analysis pipelines for different applications.
- Review the changes in the latest version v9.0.
- Cover new recommendations for selected analysis pipelines.
- Discuss command line alternatives to selected SMRT Link pipeline.
Date & Time:
2020년 8월 13일 목요일, 오전 11시 (한국시간)
Speakers :
Khi Pin Chua, Ph.D.
Field Applications Support, Bioinformatics
PacBio Asia Pacific
Speakers :
Khi Pin Chua, Ph.D.
Field Applications Support, Bioinformatics
PacBio Asia Pacific