Variant Calling and De Novo Genome Assembly with PacBio HiFi Reads
정확도가 높고 (>99%), 길이가 충분히 긴 (15-20kb) PacBio HiFi reads는 구조 변이 혹은 단일염기 변이 분석 및 de novo genome assembly 등의 포괄적인 유전체 분석에 유용합니다.
이번 웨비나에서는 HiFi read를 variant calling과 de novo genome assembly에 어떻게 활용될 수 있는지 확인하실 수 있습니다. 세부 내용은 아래와 같습니다.
- How easy it is to use HiFi reads for de novo genome assembly in humans and across the tree of life.
- How to evaluate the quality of your HiFi assembly using the three C’s: contiguity, completeness and correctness.
- How the Google AI team retrained DeepVariant, a highly accurate SNP and Indel caller, for PacBio HiFi data.
- How PacBio HiFi data can improve the Genome in a Bottle benchmark sets.
Date & Time:
Friday, March 27, 2020 12:00 p.m. Seoul
Speakers :
 | Sarah Kingan, Ph.D. Staff Scientist PacBio |  | Andrew Carroll, Ph.D. Product Lead, Genomics Google AI |
 | Billy Rowell Sr. Bioinformatics Scientist PacBio |
Recording
