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Revio system
Revio system
PacBio
Reveal More with long-read sequencing at scale
제품특징
UNLEASH THE POWER OF HIFI SEQUENCING
The Revio system adds affordability, high throughput, and ease of use to a foundation of long reads, exceptional accuracy, and direct methylation detection.
See it all with HiFi sequencing on the Revio system
▶Feature
* 15× increase in HiFi read throughput
2,500만 ZMW를 가진 고밀도SMRT Cell을 최대 4개까지 동시에 24-hour run time으로 진행할 수 있습니다.
Revio system은 하루 360Gb의 HiFi read를 생성하며 연간 1,300개의 human whole genome을 소화할 수 있습니다.
* The complete, phased genome
HiFi sequencing은 단일 라이브러리 및 단일 sequencing run으로 small variants, structural variants, repeat expansions, methylation, haplotype phasing 분석이 가능합니다.
* 50% fewer consumables and a vastly simplified experience
Run setup이 빠르고 시약과 샘플 플레이트를 합쳐 보다 간편하게 실험을 진행할 수 있습니다. 또한 시퀀싱이 진행되는 동안 실행 대기를 할 수 있고 질소 공급이 필요 없기 때문에 작동이 간단해졌습니다.
* Google Health DeepConsensus on board
Revio 시스템에 적용되는 보다 발전된 알고리즘으로 run마다 매우 높은 read accuracy 와 methylation calling을 진행할 수 있습니다. smart read ordering과 quality value binning으로 최적화된 파일 형식은 data 저장에 필요한 공간을 줄일 수 있습니다.
HIFI SEQUENCING AT SCALE
Revio 시스템은 Sequel IIe 시스템보다 15배 더 많은 연간 1,300개의 인간 게놈 분량을 분석할 수 있습니다.
SIMPLIFIED CONSUMABLES
Revio 시스템은 사용되는 소모품을 줄이고 더 쉽게 tracking할 수 있도록 최적화하였습니다. 워크플로우 개선으로 장비에 소모품을 장착하는 데 1분 미만이 소요됩니다.
- Revio polymerase kit
Revio polymerase kit에는 24개의 SMRTbell 라이브러리에 사용할 polymerase 바인딩 시약이 포함되어 있습니다.
- Revio SMRT Cell tray
하나의 트레이에는 각각 2,500만 개의 ZMW를 가진 4개의 고밀도 SMRT 셀로 구성되어 있습니다.
- Revio sequencing plate
시퀀싱 플레이트는 최대 4개의 Revio SMRT 셀 시퀀싱을 위한 시약으로 구성되어 있고 기존 Sequel IIe 시스템의 여러 파트(sequencing plate, sample plate, mixing plate, and SMRT Cell oil)을 하나로 합쳤습니다.
THE EASY-TO-USE REVIO SYSTEM FITS YOUR SCHEDULE
Revio 시스템은 확장성과 편의성을 고려하여 설계된 소프트웨어와 보다 단순화시킨 consumable을 사용헙나다.
- Fast, reliable library preparation
Revio syste의 library prep 단계는 SMRTbell prep kit 3.0를 사용하여 manual 또는 자동화 장비를 사용하여 진행할 수 있습니다.
- Rapid run setup
Sequencing plate는 NFC tag를 활용하여 run design에 연결할 수 있어 기기에서 1분 이내에 실행을 설정할 수 있습니다.
- Independent sequencing stages
Revio 시스템의 work deck은 4개의 시퀀싱 stage에서 분리되어있어 시퀀싱이 진행되는 동안에 다음 런실행을 위해 소모품을 장착할 수 있습니다.
- Simplifying laboratory requirement
새로운 flowcell design으로 외부에서 질소 공급을 할 필요가 없습니다.
MASSIVE COMPUTE POWER
Revio 시스템에는 파워풀한 NVIDIA GPU가 내장되어 있어 Sequel IIe 시스템의 20배 이상의 컴퓨팅 성능을 가지고 있습니다. 또한 시스템에서 바로 정확하고 정확하고 즉시 사용할 수 있는 데이터를 제공합니다.
- HiFi read generation
GPU는 빠른 시간 내에 basecalling 및 HiFi read를 생성하여 HiFi read를 BAM 형식으로 직접 출력합니다
- Google Health DeepConsensus
DeepConsensus는 고급 딥 러닝 기술을 사용하여 보다 많은 양의 정확한 HiFi 시퀀싱 데이터를 생성합니다
- Methylation calling
일반적으로 진행되는 run에 polymerase kinetics를 처리하는 딥 러닝 알고리즘으로 계산된 DNA methylation status가 포함됩니다
- Demultiplexing
Barcode multiplexing을 포함한 모든 기본 처리 단계가 기기에서 수행됩니다.
HIFI LEVEL ACCURACY AND DATA QUALITY
Revio 시스템은 기존 HiFi sequening 과 유사하거나 더 길고 더 좋은 quality의 read를 생성하며, variant calling performance 수생성합니다.
- Read length
수십 킬로베이스 길이의 HiFi read로 넓은 영역의 variant와 분석이 어려운 영역에 매핑이 가능합니다.
- Read and base quality
Revio 시스템은 염기서열의 90%가 ≥Q30이고 median read accuracy가 ≥Q30인 탁월한 정확성을 보이며 신뢰할 수 있는 분석결과를 제공합니다.
- Variant calling
Revio 시스템의 HiFi 시퀀싱은 모든 유형의 변이에 대해 높은 정확도를 제공하여 Sequel IIe 시스템의 PrecisionFDA-winning accuracy의 정확도에 버금가는 정확성을 보입니다.
▶Workflow
▶Applications
