REVEAL HIDDEN ISOFORM
DIVERSITY AT SINGLE-CELL RESOLUTION
isoform 수준에서 세포 이질성을 이해하는 것은 일반 연구 및 질병 연구 모두에 중요합니다. PacBio HiFi
sequencing은 단일 세포 바코드 및 UMI 정보와 함께 전체 길이의 RNA isoform의 서열을 분석하여 단일 세포 생물학에 대한 전례 없는 인사이트를 보여줍니다. short read는 유전자 수준의 정보만 캡처할 수 있고 다른 long read 기술은 UMI(고유 분자 식별) 및 CBC(세포 바코드) 식별에 대한 정확도가 부족합니다. HiFi read만이 단일 세포 연구에서 isoform을 정확하게 검출할 수 있습니다.
Long reads reveal isoform differences across cell types.
MAS-Seq 방법은 Single-cell 플랫폼에서 생성된 cDNA 분자를 더 긴 단편으로 연결하여 처리량을 증가시키는 concatenation method로 Al'Khafaji 박사 연구팀에 의해 개발되었습니다.
MAS-Seq kit를 사용하면 단일 세포 수준에서 RNA isoform의 다양성을 엿볼 수 있습니다. |
References
HiFi Reads Offer the Benefits of Short Reads and Long Reads in One Easy-to-Use Technology
HiFi read는 모든 변이 유형을 감지할 수 있는 높은 정확도 (> 99.9 %)와 가장 복잡한 유전체와 전체 전사체를 assemble하는데 필요한 충분히 긴 길이(최대 25kb)를 제공합니다.