NEWS & RESOURCES

PUBLICATION

(주)엠디엑스케이는 고객의 연구 목적에 적합한 기술과 서비스를 제공합니다.

  • home
  • NEWS & RESOURCES
  • PUBLICATION

[실제연구사례] 신시내티 어린이 병원 연구팀의 single cell RNA isoform sequencing 이야기

2023-04-21 10:17:39

유전자가 아닌 isoforms single-cell 연구에 중요할까요?


isoform
수준에서 세포 이질성을 이해하는 것은 기초 질병 연구에 매우 중요합니다. 그러나 현재 short reads로는 유전자 수준의 정보만 포착할 있으며, long-read technologies로는 UMI/바코드 식별을 위한 정확성이 부족합니다.

PacBio HiFi
단일 세포 바코드 UMI 정보와 함께 전체 길이의 RNA isoform 서열을 분석하여 단일 세포 생물학에 대한 전례 없는 인사이트를 보여줍니다


 

 

PacBio 최신 Single-Cell RNA isoform sequencing MAS-Seq 방법을 사용하면 다음과 같은 이점이 있습니다.

기존 Single-cell Iso-Seq 라이브러리에 비해 처리량이 16 향상됩니다.
• Full-length isoform
정보까지 확인가능합니다.
단일 세포 수준에서 transcript isoform 전체적인 다양성의 특성 분석이 가능합니다.
세포 유형별 spliced isoform expressed variants 보여줍니다.
 

 

 

신시내티 어린이 병원 의료 센터 Nathan Salomonis 박사 팀의 Revio 시스템과 MAS-seq for 10x Single Cell 3' kit hematology 연구에 적용한 실제 사례를 on-demand webinar 통해서 확인해보세요!
 


 

 

MAS-Seq 방법은 새로운 키트형 단일 세포 전사체 분석 솔루션입니다. 기존 single cell workflow 쉽게 통합하여 라이브러리 제작을 진행할 있고 사용자 친화적인 분석 워크플로우로 결과를 확인할 있습니다.  

 

 

 

HiFi Reads Offer the Benefits of Short Reads and Long Reads in One Easy-to-Use Technology

 

HiFi read 모든 변이 유형을 감지할  있는 높은 정확도 (> 99.9 %) 가장 복잡한 유전체와 전체 전사체를 assemble하는데 필요한 충분히  길이(최대 25kb) 제공합니다.