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신경계에서 target mRNA level 및 세포유형을 확인하는 방법

2022-07-18 14:46:22

신경 과학(neuroscience) 분자 세포 수준에서 시스템 수준에 이르기까지 중추(CNS) 말초 신경계를 연구하는 가장 빠르게 성장하는 연구 분야 하나입니다.

RNAscope
in situ hybridization 분석은 공간 형태학적 맥락을 유지하면서 단일 전사체 검출 수준 단일 세포 분해능에서 매우 민감하고 특이적 유전자 발현 분석을 가능하게 함으로써 이러한 문제를 해결하게 합니다. 특히, 다중 뉴런 세포 마커의 동시 검출을 위한 다중화 기능은 강력한 유전자 발현 분석 신경계 내의 별개의 세포 집단의 시각화를 가능하게 합니다

RNAscope®
Target-specific signal 증폭시키기 위한 독점 probe design 알고리즘을 사용하여 조직과 세포내에서 target RNA 시각화 있는 빠르고 민감성이 높은 분석법을 제공합니다.

 

 

 

 

 

 RNAscope® ISH 분석은 다음과 같은 neuroscience 연구에 활용될 있습니다.
* 신경계에서 target mRNA level 확인 세포유형 확인
*
신경계의 유전적 변형 검증
*
신뢰할 있는 항체가 없을 , 신경계에서 mRNA 검출 Long non-coding RNA 검출
*
신경계의 신경망 활동 마커의 시각화

 

 
 

Neuroscience 연구에 ACD RNAscope® 활용한 여러 data 확인해보실 있습니다

 

신경계에서 target mRNA level 세포유형 확인
 

 

뉴런 신경교 세포의 표적 발현 패턴을 구별하기 위해 일반적으로 사용되는 세포 유형 마커에는 각각 뉴런, 소교세포 성상교세포의 검출을 위한 Rbfox3, Aif1 Gfap 있습니다.
형광으로 검출가능한 RNAscope multiplex 사용하여 mouse brain hippocampus Fresh frozen section 에서 이러한 3개의 별개의 세포 집단을 동시에 검출할 있었습니다.


 

신뢰할  있 항체가 없을 신경계에서 mRNA 검출
  

G-단백질 결합 수용체(GPCR) 다양한 외부 신호에 반응하는 세포 표면 수용체입니다.
신호 분자를 GPCR 결합시키면 G 단백질이 활성화되고, 이는 다시 임의의 수많은 다른 조절자들에게 신호를 전달 합니다. 따라서 GPCR 감각에서부터 성장, 호르몬 반응까지 신체 기능의 믿을 없는 범위를 조절하는데 관련이 있습니다.
하지만, G-단백질 결합 수용체(GPCR)관련 항체는 GPCR 세포에서 낮은 수준으로 발현되고, 항체가 정제될 불안정한 경향이 있기 때문에 적절한 항원으로 사용할 없어 분석에 사용하기 어렵습니다.
RNAscope
이용하여, Mouse brain FFPE Sample에서 GPCR expression 확인 있습니다.


 

 

Long non-coding RNA 검출

 

 

Long non-coding RNA 단백질 코딩 가능성이 없는 200 이상의 뉴클레오티드 길이를 가진 크고 다양한 종류의 RNA 전사체입니다.
최근 연구에 따르면 lncRNA 신경 발달과 기능에 관여하는 것으로 나타났습니다.
기능적 중요성에도 불구하고, lncRNA 세포 과정을 제어하는 메커니즘은 여전히 파악하기 어렵습니다.

Mouse brain
에서 lncRNA 검출하기 위하여 lncRNA marker NEAT1(red) MALAT1(=NEAT2)(green) RNAscope 이용하여 조직 제한 발현 패턴, lncRNA 발현을 시각화 하여 brain에서의 lncRNA 기능을 밝힐 있습니다.