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BaseScope™ Manual Assays

BaseScope™ Manual Assays

ACD

조직, 세포내에서 target point mutation 등의 짧은 RNA를 시각화 할 수 있는 빠르고 민감성이 높은 분석할 수 있는 BaseScope Reagent Kits for benchtop protocols

제품특징

  

ACD의 Basescope® HD assay in situ hybridization은 Target-specific signal을 증폭시키기 위한 독점 probe design (double ZZ) 알고리즘을 사용하여 조직, 세포내에서 target point mutation 등의 짧은 RNA를 시각화 할 수 있는 빠르고 민감성이 높은 분석법을 제공합니다. 단일 세포 수준으로 point mutation, short/highly homologous genes, splice variants를 확인할 수 있습니다.

 

Features


  • Detect biological events in situ using a single Z pair (i.e. RNA sequence spanning 50bp)
  • One assay for short sequence(50-300 bases), exon junction and RNA mutation analysis (splice variants, circular RNA, or gene fusions)
  • 간편하고 빠른 실험 과정으로 하루에 결과를 볼 수 있다.
  • 세포 모양과 RNA 발현 정도를 동시에 볼 수 있다.
  • Low level RNA expression에서도 측정 가능하다.
  • Single RNA molecule로 detection되어 정량할 수 있다.
  • 원하는 RNA의 Probe를 Design 할 수 있다.


▶Application

  • Visualizing splice variants/exon junctions
  • Visualizing short & highly homologous sequences (CRISPR constructs, T-cell receptors)
  • Simultaneously visualizing wild types and point mutations
  • FFPE cells & tissues (TMAs) and fresh or fixed frozen tissues
  • Dual BaseScope ISH and IHC/IF assays in the same tissue section


Workflow






▶RNAscope/BaseScope/ miRNAscope Assay Selection Guide

 

 RNAscope Assay

BaseScope Assay

miRNAscope Assay 

 

 

 

 

Number of ZZ Pair per target

 

  • Standard probe design is 20 ZZ probes (minimum of 6 ZZ probes)

 

 

  • 1 to 3 ZZ probes based on the application

 

 

  • N/A

 

 Target

  • mRNA >300 bases
  • lncRNA > 300 bases

 

  • Exon junctions/Splice Variants
  • RNA 50 to 300 bases
  • Validated point mutations

 

 

  • Small RNAs 17-50 bases ASOs, miRNAs, siRNAs

 

Application

 

  • lcnRNA and mRNA >300 bases

 

 

  •  Exon junctions/splice variants, circular RNA, gene fusion, gene knockout
  • Short/highly homologous sequences, TCRs and CDR sequence for T cell clones, pre-miRNA, gene editing/CRISPR, CAR-T cell validation and detection
  • Point mutation, short InDel, homologuesa

 

 

  • Small RNAs 17-50 bases 
  • ASOs, miRNAs, piRNAs, shRNAs, siRNAs, and tRNAs

 

Multiplex capability 

 

  •  Single to up to 12-plex

 

 

  • Single to Duplex 

 

 

  • Single-plex 

 

 Detection

 

  •  Chromogenic or fluorescent

 

 

  •  Chromogenic

 

 

  •  Chromogenic

 

 Sample type

  • FFPE cells & tissues (TMAs)
  • Fresh frozen tissues
  • Fixed frozen tissues
  • Cultured cells
  • FFPE cells & tissues (TMAs)
  • Fresh frozen tissues
  • Fixed frozen tissues
  • Cultured cells
  • FFPE cells & tissues (TMAs)
  • Fresh frozen tissues
  • Fixed frozen tissues
  • Cultured cells

 Pretreatment kit

 

  • Reagent Kit includes Universal Pretreatment Kit 

 

 

  • Reagent Kit includes Universal Pretreatment Kit 

 

 

  •  Reagent Kit includes Universal Pretreatment Kit 

 

 Kit

  • RNAscope kit  
  • BASEscope kit 
  • miRNAscope kit 

 Probe

  • RNAscope Probe 
  • BASEscope probe 
  •  miRNAscope probe 

 Automation

  • Available on Leica Bond Rx and Ventana Discovery ULTRA 
  • Singleplex available on Leica Bond Rx and Ventana Discovery ULTRA 
  • Available on Leica Bond Rx 

 ​


▶Product Overview



 


Publication list







       

품목정보

품번 품명 가격
322900 BaseScope™ Reagent Kit – RED 견적문의
322970 BaseScope™ Intro Pack- Reagent Kit- Red- Hs 견적문의
322971 BaseScope™ Intro. Pack for Reagent Kit Red – Mm 견적문의
322972 BaseScope™ Set Up Fee 견적문의
문의 요망 BaseScope™ Probes 견적문의