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Long Look Into Ant Brains Provides Epigenetic Insights

2018-07-25 13:36:42

PUBLICATION NEWSLETTER 

 

CC BY Bob Peterson
  


​뇌 기능과 행동에 대한 후성유전적 조절을 이해하기 위해 Pacbio SMRT sequenicng 기법을 적용하여 개미를 연구한 논문입니다. 

 

많은 개미 종들에 대하여 whole-genome shotgun sequencing이 이루어졌지만, 기존의 assembly 결과들은 단편화된 draft이기 때문에 후성유전적 연구에 이용하는 것이 거의 불가능하였습니다. 이 논문의 연구팀은 Camponotus floridanus와 Harpegnathos saltator ant 종에서 표현형과 행동가소성에 관여하는 후성유전적 변화를 확인하기 위해 Pacbio SMRT Sequencing을 사용하여 de no assembly를 수행하였습니다. 

 

Short read로 수행한 분석보다 향상된 결과 덕분에 protein-coding 및 non-coding RNA를 포괄적으로 이해할 수 있었고,  일부 일개미가 그들의 군락내에서 왕비가 될 수있게 하는 차별화 된 유전자 발현에 관한 몇 가지 의문점에 답을 찾을 수 있었습니다. 특히, 단백질로 번역되지 않는 200 base pair 보다 긴 non-coding RNA (lncRNA)에 대한 annotation은 사람, 생쥐, 꿀벌 등 다른 생물체에 비하여 미흡했기 때문에 연구팀은 더 많은 관심을 가졌습니다. 

 

Long PacBio read를 분석하여 크게 향상된 Harpegnathos 종과 Camponotus 종의 어셈블리 결과는 이 개미종을 분자 모델생물로 발전시키는 것에 중요한 이점을 제공할 것입니다. 또한 사회적 곤충들의 행동의 기저가 되는 유전적 및 후천적 요인에 대한 더 큰 이해로 이어질 것이라고 저자들은 말합니다. 

 

 

High-Quality Genome Assemblies Reveal Long Non-coding RNAs Expressed in Ant Brains