Sequencing 101: How Long-Read Sequencing Improves Access to Genetic Information
Introduction of PacBio technology : Long read의 유용성, PacBio long read sequencing이 다른 기술과 어떻게 다른지, application 및 연구에 어떻게 활용될 수 있는지 소개합니다.
PacBio Global Summit
지역별로 진행되었던 User group meeting이 2020년에는 하나로 합쳐져 이틀 동안 연구팀들의 프레젠테이션, 워크숍, 라이브 Q & A, 새로운 CEO, Christian Henry와의 만남 등의 session들로 진행이 되었습니다.등록하시면 ON-DEMEND로 보실 수 있습니다.
Plant and Animal Genomics (PAG) Conference
Sanger Institute’s Darwin Tree of Life project 업데이트를 포함하여 Genetwister Technologies의 4 배체 장미 어셈블리, Iso-seq data를 이용한 Great Apes work, 애리조나 대학교의 PacBio ribosomal DNA sequencing을 이용한 식물 공생 곰팡이 phylogeny 연구 등을 확인해보세요!
SMRT Leiden
식물, 동물, 인간 및 미생물 연구진들의 최고의 강연뿐만 아니라 NIH의 척추 동물 게놈 프로젝트의 리더 연구진의 keynote session과 생물 정보학 세션도 포함되었습니다.
등록하시면 ON-DEMEND로 보실 수 있습니다.
Advances in Genome Biology and Technology (AGBT) Conference
McDonnell Genome Institute 연구팀은 PacBio 시퀀싱을 사용하여 reference-grade 인간 게놈 어셈블리를 생성하는 방법을 설명하였습니다. Uppsala University 연구팀은 CRISPR-Cas9 유전자 편집 연구에서 long read sequencing 활용한 off-target 결과 검출을 발표하였습니다. 그리고 USDA 연구팀의 곤충을 기반으로 하는 식량 공급원 개발에 관하여 확인하실 수 있습니다.
PacBio Neuroscience Day
Neuroscience에 초점을 맞춘, 새로운 희귀 질환 연구결과 살펴볼 수 있는 이벤트를 선보였습니다. Repeat expansion의 발견 및 새로운 carrier screening 방법에 이르기까지 25 개 세션에서 ALS, 알츠하이머 및 운동 실조증에서 근이영양증, 파킨슨 병, 진행성 핵상 마비 및 정신 분열증에 이르기까지 다양한 주제와 질병을 다루었습니다. 등록하시면 ON-DEMEND로 보실 수 있습니다.
American Society of Human Genetics (ASHG)
ASHG에서는 신경계의 single cell isoform analysis 부터 희귀 질환 사례에 이르기까지 PacBio long read 시퀀싱 기술을 사용하는 다양한 애플리케이션 강연 및 비디오 포스터를 선보였습니다.
Beyond a Single Reference Genome – The Advantages of Sequencing Multiple Individuals
각 종에 대한 단일 참조 게놈이 충분하지 않다는 것이 점점 분명해짐에 따라 많은 연구자들은 Pangenome collection을 만드는 데 관심을 가지고 있습니다. 그래서 Corteva의 Kevin Fengler와 Penn State의 Matthias H. Weissensteiner로부터 유전적 변이에 대한 포괄적인 해석을 위해 HiFi read를 이용할 때 속도, 비용, 정확도에 있어서의 잇점을 확인해 보실 수 있습니다.
A HiFi View: Sequencing the Gut Microbiome with Highly Accurate Long Reads
Sequel II 시스템이 복잡한 메타 유전체학 프로젝트에 어떻게 활용될 수 있는지 확인하실 수 있습니다. 미숙아의 장 증후군에 관련된 미생물 바이오 마커 연구와 16S 유전자에서 종 내 변이를 확인하여 인간 장내 미생물 군집을 균주 수준으로 분류할 수 있는 매우 정확한 long read의 활용을 살펴보세요!
Long-Read Sequencing in COVID-19 Research
Opportunities for using PacBio Long-read Sequencing for COVID-19 Research
이 Labroots 웨비나에서는 HiFi 시퀀싱이 바이러스 안정성 및 돌연변이율을 이해하기 위해 돌연변이 단계 및 희귀 변이 검출에 어떻게 사용될 수 있는지 설명하였습니다.
Understanding SARS-CoV-2 and Host Immune Response to COVID-19 with PacBio Sequencing
PacBio Sequencing을 이용한 고해상도 HLA 유형 분석을 통해 숙주 면역 반응의 영향을 평가한 연구와 항체 매개 면역에서 IGH haplotype의 다양성이 갖는 역할에 대해 확인하실 수 있습니다.
HiFi Reads Offer the Benefits of Short Reads and Long Reads in One Easy-to-Use Technology
HiFi read는 모든 변이 유형을 감지할 수 있는 높은 정확도 (> 99.9 %)와 가장 복잡한 유전체 와 전체 전사체를 assemble하는데 필요한 충분히 긴 길이(최대 25kb)를 제공합니다.
