국내에서 미생물 유전체 연구를 진행하고 계시는 연구자분에게 빠르고 보다 적은 비용으로 미생물군유전체를 strain 수준으로 분석가능한 DNA sequencing assay를 소개드리고자 이번 웨비나를 마련하였습니다.
Shoreline Complete StrainID™kit 와 SBanalyzer™ software, & Athena™ database를 활용하여 새로운 박테리아 균주를 식별 및 분류하는 방법과 PacBio long read full length 16S amplicon
sequencing을 이용하여 metagenome 분석을 어떻게 진행하는지, 확인하실 수 있습니다.
이번 세미나에서는 아래와 같은 내용으로 진행됩니다.
Identification &
Classification of Novel Bacterial Strains
Identification and
classification of bacterial strains using Shoreline Biome microbiome NGS prep
kits and SBanalyzer software with Athena Database
Long-Read
Sequencing for High-Resolution Metagenomics
Generating new
insights into how microbial communities function and interact with their
environments requires improved approaches. Long-read sequencing enables
species-level resolution and drives functional insights with full-length 16S
sequencing and 10 kb HiFi reads for metagenome profiling and assembly.
미생물 집단이 인간의 건강에 어떻게 영향을 미치는지 보다 더 잘 이해하기 위해 서는 Strain 수준의 미생물 프로파일링이 필요합니다.
rRNA gene amplicon을 이용한 미생물 프로파일링은 빠르고 적은 비용으로 할 수있어 널리 알려진 방법이지만, 현재 사용되고 있는 short-read 16S rRNA 방법은 일반적으로 근접한 연관 관계에 있는 변종을 구별할 수 없습니다.
“Shoreline Complete Strain ID Kit”는 16S-23S long amplicon을 구성하여 PacBio사의 Sequel system에 적용, High throughput으로 빠르게 rRNA 유전자를 분석, Strain 수준의 분류를 할 수 있습니다.
Lysis 부터 DNA추출, 긴 amplicon primers 및 database를 포함한 분석 소프트웨어까지 제공함으로써 근접 관계에 있는 미생물 strain도 구별할 수 있습니다.