NEWS & RESOURCES

EVENTS

(주)엠디엑스케이는 고객의 연구 목적에 적합한 기술과 서비스를 제공합니다.

  • home
  • NEWS & RESOURCES
  • EVENTS

박테리아 균주를 strain 수준까지 식별하는 방법

2020-11-19 11:27:17
16
D-DAY

 


 

Identification and Classification of Novel Bacterial Strains


국내에서 미생물 유전체 연구를 진행하고 계시는 연구자분에게 빠르고 보다 적은 비용으로 미생물군유전체를 strain 수준으로 분석가능한 DNA sequencing assay 소개드리고자 이번 웨비나를 마련하였습니다.

Shoreline Complete StrainID™kit
SBanalyzer™ software, & Athena™ database 활용하여 새로운 박테리아 균주를 식별 분류하는 방법과 PacBio long read full length 16S amplicon sequencing 이용하여 metagenome 분석을 어떻게 진행하는지, 확인하실 있습니다.

이번 세미나에서는 아래와 같은 내용으로 진행됩니다.
 

 



 

Identification & Classification of Novel Bacterial Strains
Identification and classification of bacterial strains using Shoreline Biome microbiome NGS prep kits and SBanalyzer software with Athena Database




Long-Read Sequencing for High-Resolution Metagenomics
Generating new insights into how microbial communities function and interact with their environments requires improved approaches. Long-read sequencing enables species-level resolution and drives functional insights with full-length 16S sequencing and 10 kb HiFi reads for metagenome profiling and assembly.








 





     

미생물 집단이 인간의 건강에 어떻게 영향을 미치는지 보다 이해하기 위해 서는 Strain 수준의 미생물 프로파일링이 필요합니다.

rRNA gene amplicon
이용한 미생물 프로파일링은 빠르고 적은 비용으로 수있어 널리 알려진 방법이지만, 현재 사용되고 있는 short-read 16S rRNA 방법은 일반적으로 근접한 연관 관계에 있는 변종을 구별할 없습니다

“Shoreline Complete Strain ID Kit”
16S-23S long amplicon 구성하여 PacBio사의 Sequel system 적용, High throughput으로 빠르게 rRNA 유전자를 분석, Strain 수준의 분류를 있습니다.

Lysis
부터 DNA추출, amplicon primers database 포함한 분석 소프트웨어까지 제공함으로써 근접 관계에 있는 미생물 strain 구별할 있습니다.