2020 HiFi for All – Collaborations
SMRT Grant Program
여러분의 공동 연구에 PacBio HiFi read를 적용해 보실 기회를 잡으세요!
Whole genome sequencing에서 RNA sequencing에 이르기까지
모든 응용 분야의 공동 프로젝트에 최대 10개의 8M SMRT cell을 제공합니다.
제안서가 채택되신 팀에게는 HiFi sequencing data 및 분석에 대한
지원의 혜택까지 받을 수 있습니다.
제안서 마감
2021년 1월 22일 (미국시간)
지원 내용
SMRTbell library preparation
Whole genome sequencing에서 RNA sequencing에 이르기까지
모든 응용 분야의 공동 프로젝트에 최대 10개의 8M SMRT cell을 제공합니다.
제안서가 채택되신 팀에게는 HiFi sequencing data 및 분석에 대한
지원의 혜택까지 받을 수 있습니다.
제안서 마감
2021년 1월 22일 (미국시간)
지원 내용
SMRTbell library preparation
Up to 10 SMRT Cells 8M
Sequencing on the Sequel II System
Sequencing on the Sequel II System
Analysis support from a PacBio bioinformatician
HiFi Reads Offer the Benefits of Short Reads and Long Reads in One Easy-to-Use Technology
HiFi read는 모든 변이 유형을 감지할 수 있는 높은 정확도(> 99.9 %)와 가장 복잡한 유전체와 전체 전사체를 assembly하는데 필요한 충분히 긴 길이(최대 25kb)를 제공합니다.
Video Poster: Accurate, comprehensive variant calling in difficult-to-map genes using HiFi reads
인간유전체에서 약 5 % 의 단백질 코딩 유전자에는 동종 유사 유전자 또는 분절 중복으로 인해 전형적인 NGS 방법으로는 매핑하기 어려운 엑손이 포함되어 있습니다. Long read DNA sequencing은 상동성 엑손을 이웃하는 고유 서열에 연결하여, 매핑하기 어려운 많은 영역의 매핑 가능성을 높입니다. 최근 개발된 PacBio HiFi read는 매핑 가능성을 높인 긴 길이 (15kb – 25kb)와 정확한 변이 호출을 위한 고품질 (> 99 %)을 제공하여 분석 가능한 게놈 영역이 보다 넓어졌습니다.
PacBio HiFi read가 다른 NGS 기술과 비교할 때 매핑하기 어려운 유전자에서 22 % 더 많은 benchmark variant를 검출한 방법에 대해 확인하실 수 있습니다.
