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Small Bodies, Big Genomes: Overcoming Large DNA Input Requirements for Long-Read Genome Assembly

고품질의 참조게놈은 식물 및 동물 유전체학 연구에 있어 필수적인 툴입니다. 그러나 상대적으로 많은 양의 DNA가 필요하여 (표준 라이브러리의 경우 5µg 이상) DNA 함량이 한정되어 있는 작은, 비 근교계 (non-inbred) 생물체를 연구하는 프로젝트에서는 PacBio 게놈 어셈블리를 생성하는 것이 쉽지 않았습니다. 

이번 웨비나에서는 라이브러리 제작부터 시퀀싱 까지 적은 양의 DNA input으로 진행하는 workflow를 소개합니다. 작은 생물체로부터 고품질의 참조 게놈을 생성할 수 있음을 실제 사례로 살펴보실 수 있습니다. 

게놈 사이즈가 약 1.6Gb이고 빙하에서 서식하는 북미아이스웜 (North American ice worm)이 극한 환경에서 어떻게 적응할 수 있는지에 대한 연구에 적용된 사례를 확인해보세요. 

Date/Time

9월 13일 오전 1시 30분, 한국시간

(Thursday, September 12, 2019 9:30 a.m., PDT)

Abstract

- The requirements for use of the low DNA input workflow for genome assembly.

- How the low DNA input workflow enabled sequencing of the large genome of the small-bodied ice worm.

Speakers

Erin Bernberg, Ph.D., Senior Scientist, University of Delaware, Sequencing and Genotyping Center

Scott Hotaling, Ph.D., Postdoctoral Researcher ,School of Biological Sciences, Washington State University